1.從保存于含有羰基的液體細胞防腐保存液中的生物樣品提取靶標核
酸的方法,該方法包括:
A)使所述生物樣品與包含清除劑的清除溶液接觸,所述清除劑包含至少
一個末端肼基;
B)在足以使核酸從生物樣品釋放的條件下處理所述生物樣品;以及
C)分離所述靶標核酸。
2.權利要求1的方法,其中所述清除劑選自:
a)式I的化合物:
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b)式II的化合物:
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其中:
R
1為C
1–C
12烷基;C
1–C
12烯基;C
3–C
6環烷基;C
3–C
6環烯基;C
6–C
10芳基;和C
6–C
10雜芳基,其中R
1為任選取代的由此增加所述清除劑在水中
的溶解度;
R
2在每種情況下可相同或者不同,且選自:
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m為選自0和1的整數;且
n為選自1和2的整數,
其中所述清除劑為任選修飾的由此增加在水中的溶解度。
3.權利要求2的方法,其中所述清除劑為式I的化合物,其中R
1為
C
1–C
12烷基且m為1。
4.權利要求3的方法,其中R
1為C
1–C
6烷基。
5.權利要求3的方法,其中R
1為C
2–C
4烷基。
6.權利要求2的方法,其中所述清除劑為式II的化合物,其中R
1為
C
1–C
12烷基;R
2為
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且n為2。
7.權利要求6的方法,其中R
1為C
1–C
6烷基。
8.權利要求6的方法,其中R
1為C
2–C
4烷基。
9.權利要求1的方法,其中所述清除劑選自氨基脲;氨基硫脲;卡巴
肼;硫代卡巴肼;N-氨基胍及其鹽;N,N-二氨基胍及其鹽;乙酰肼;己二酸
二酰肼;琥珀酸二酰肼;甲酰肼;馬來酸二酰肼;丙二酸二酰肼;苯磺酰肼;
甲苯磺酰肼;和甲磺酰肼。
10.權利要求1至9中任一項的方法,其中所述清除溶液包含0.1M至
1.0M的所述清除劑。
11.權利要求1至9中任一項的方法,其中所述清除溶液包含0.1M至
0.5M的所述清除劑。
12.權利要求1至9中任一項的方法,其中所述清除溶液包含0.2M至
0.4M的所述清除劑。
13.權利要求1至9中任一項的方法,其中所述清除溶液包含0.3M己
二酸二酰肼或者0.3M琥珀酸二酰肼。
14.權利要求1至9中任一項的方法,其中所述清除溶液直接加至所述
液體細胞防腐保存液。
15.權利要求1至9中任一項的方法,其中所述清除溶液進一步包含蛋
白消化酶。
16.權利要求1至9中任一項的方法,其中在所述靶標核酸從生物樣品
釋放之前,使所述生物樣品與所述清除溶液接觸。
17.權利要求1至9中任一項的方法,其中通過在裂解溶液的存在下裂
解所述生物樣品將所述靶標核酸從生物樣品釋放。
18.權利要求17的方法,其中所述清除溶液為裂解溶液。
19.權利要求17的方法,其中在將裂解溶液加至生物樣品之前、之后
或者同時將所述清除溶液加至生物樣品。
20.權利要求1的方法,其中:
C)所述靶標核酸通過以下方法來分離,所述方法包括:
(i)使用第二核酸將核酸探針與所述靶標核酸雜交以形成核酸雜交
物;
(ii)使所述核酸雜交物與固相結合;
(iii)分離所述固相;和
(iv)從所述固相洗脫所述靶標核酸。
21.權利要求20的方法,其中所述核酸雜交物為DNA:RNA雜交物且
其中通過以下方法使所述DNA:RNA雜交物與固相結合,所述方法包括:使
所述核酸雜交物與能夠結合所述核酸雜交物的抗體接觸,其中所述抗體與所
述固相結合或者適于與所述固相結合。
22.權利要求1的方法,其中:
C)所述靶標核酸通過以下方法來分離,所述方法包括:
(i)使所述靶標核酸與陰離子交換基質結合;和
(ii)從所述陰離子交換基質洗脫所述靶標核酸。
23.權利要求22的方法,其中所述靶標核酸在20℃至70℃的洗脫溫
度從所述陰離子交換基質洗脫。
24.權利要求22或23的方法,其中所述靶標核酸在50℃至60℃的
洗脫溫度從所述陰離子交換基質洗脫。
25.裂解溶液,包含:
(i)緩沖劑;
(ii)洗滌劑;
(iii)包含至少一個末端肼基的清除劑;且
(iv)任選的蛋白消化酶。
26.權利要求25的裂解溶液,其中所述清除劑選自:
a)式I的化合物:
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b)式II的化合物:
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其中:
R
1選自:C
1–C
12烷基;C
1–C
12烯基;C
3–C
6環烷基;C
3–C
6環烯基;C
6–C
10芳基;和C
6–C
10雜芳基,其中R
1為任選取代的由此增加清除劑在水中的溶
解度;
R
2在每種情況下可相同或者不同,且選自:
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m為選自0和1的整數;且
n為選自1和2的整數,
其中所述清除劑為任選修飾的由此增加在水中的溶解度。
27.權利要求25的裂解溶液,其中所述清除劑選自氨基脲;氨基硫脲;
卡巴肼;硫代卡巴肼;N-氨基胍及其鹽;N,N-二氨基胍及其鹽;乙酰肼;己
二酸二酰肼;琥珀酸二酰肼;甲酰肼;馬來酸二酰肼;丙二酸二酰肼;苯磺
酰肼;甲苯磺酰肼;和甲磺酰肼。
28.權利要求25至27中任一項的裂解溶液,包含0.1M至1.0M的所述
清除劑。
29.權利要求25至27中任一項的裂解溶液,包含0.1M至0.5M己二酸
二酰肼或者0.1M至0.5M琥珀酸二酰肼。
30.試劑盒,其用于從保存于液體細胞防腐保存液中的生物樣品回收靶
標核酸,所述試劑盒包含權利要求25至29中任一項的裂解溶液且任選包含
至少一種選自下述的額外組分:蛋白消化酶、固相、能夠與所述靶標核酸雜
交的核酸探針,以及抗體。