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級聯侵入信號放大反應結合納米金-寡核苷酸探針可視化核酸檢測方法

  • 專利類型:發明專利
  • 有效期:不限
  • 發布日期:2021-12-09
  • 技術成熟度:可以量產
交易價格: ¥面議
  • 法律狀態核實
  • 簽署交易協議
  • 代辦官方過戶
  • 交易成功

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  • 技術(專利)類型 發明專利
  • 申請號/專利號 CN201110161736.3 
  • 技術(專利)名稱 級聯侵入信號放大反應結合納米金-寡核苷酸探針可視化核酸檢測方法 
  • 項目單位 華東醫學生物技術研究所
  • 發明人 周國華,馬寅姣,鄒秉杰 
  • 行業類別 藥品-生物藥品
  • 技術成熟度 可以量產
  • 交易價格 ¥面議
  • 聯系人 李鑫華
  • 發布時間 2021-12-09  
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    項目簡介

    本發明屬于分子生物學領域,涉及級聯侵入信號放大反應和納米金-寡核苷酸探針可視化檢測。本發明級聯侵入信號放大反應結合納米金-寡核苷酸探針可視化核酸檢測方法包括1)第一步侵入信號放大反應,形成flap片段的積累;2)flap片段循環階段,將flap片段與發夾探針互補雜交,形成flap片段-發夾探針特殊結構,該結構被酶識別后,發夾探針被切割;3)納米金-寡核苷酸探針檢測階段,利用兩種不同寡核苷酸修飾的納米金探針,可視化檢測級聯侵入信號放大反應的結果。利用本發明檢測方法,能夠對核酸靶序列進行可視化檢測,并且由于侵入信號放大反應具有很高的特異性,可以實現對侵入位點附近的單個堿基差異的核酸序列進行區分檢測。
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  • 02

    說明書

    1.級聯侵入信號放大反應結合納米金-寡核苷酸探針可視化核酸檢測方法,其特征在于依次包括以下步驟:(1)級聯侵入信號放大反應的第一步核酸侵入信號擴增階段:設計針對靶核酸特異性的一對探針,要求與靶核酸雜交后,上游探針3’端必須侵入下游探針1個堿基,下游探針有一段翹起片段,稱為5’flap,并且其中下游探針與靶核酸互補區域的解鏈溫度在核酸5’外切酶或5’flap內切酶的酶切反應溫度±1℃范圍內,而上游探針與靶核酸互補區域的解鏈溫度要高于核酸5’外切酶或5’flap內切酶的酶切反應溫度5~10?℃;所述的靶核酸與所述的上、下游探針在核酸侵入反應體系中雜交形成探針-靶核酸特異性結構,其中下游探針濃度大于上游探針濃度;向反應體系中加入核酸5’外切酶或5’flap內切酶,核酸5’外切酶或5’flap內切酶識別所述的探針-靶核酸特異性結構,并將下游探針的5’flap連同與模板配對的第一個堿基切下,因為所述的酶切反應溫度接近下游探針與模板配對部分的熔解溫度,下游探針被切割后會很快與靶核酸分離,沒有被切割的完整的下游探針會再次與靶核酸雜交,而上游探針熔解溫度高于反應溫度,可以牢固地結合在靶核酸上,與新雜交的完整的下游探針再次形成所述的探針-靶核酸特異性結構,進而繼續被核酸5’外切酶或5’flap內切酶切割,形成flap片段的積累;(2)級聯侵入信號放大反應的flap片段循環信號擴增階段:反應體系中的發夾探針可捕獲步驟(1)積累的flap片段,并雜交形成一個flap片段-發夾探針特異性結構,該結構也可被反應體系中的核酸5’外切酶或5’flap內切酶識別,并將發夾探針的5’flap連同與模板配對的第一個堿基切下,被切割的發夾探針與步驟(1)產生的flap片段分離,沒有被切割的完整的發夾探針會再次與步驟(1)產生的flap片段雜交,再次形成所述的flap片段-發夾探針特異性結構,進而繼續被核酸5’外切酶或5’flap內切酶切割,從而大量的發夾探針被切割;(3)級聯侵入信號放大反應結果納米金-寡核苷酸探針可視化檢測階段:由于發夾探針5’端和3’端可分別與兩種納米金-寡核苷酸探針互補雜交,可使得納米金-寡核苷酸探針形成伸展的納米金顆粒-多核苷酸的多聚網狀結構,從而引發納米金的特征等離子吸收發生變化,并由此引發粒子光學性質的改變,產生發夾探針的檢測信號,即反應體系從紅色變為紫色;當反應體系中有靶核酸存在時,可觸發級聯信號放大反應,在酶的作用下,大量發夾探針被切割;待級聯信號放大反應結束后,向反應體系中加入兩種納米金-寡核苷酸探針;這時,由于發夾探針被切割,不能將兩種納米金-寡核苷酸探針連接,則不能引發納米金的特征等離子吸收發生變化,反應體系顏色不發生變化,仍然為紅色;相反,當反應體系中不存在靶核酸或靶核酸濃度過低時,則無級聯信號放大反應發生或級聯信號放大反應作用不明顯,體系中存在的發夾探針可使得納米金-寡核苷酸探針形成伸展的納米金顆粒-多核苷酸的多聚網狀結構,反應體系顏色由紅色變為紫色,從而顯示該體系中無靶核酸存在或靶核酸濃度過低。2.根據權利要求1所述的可視化核酸檢測方法,其特征在于該方法能夠檢測到濃度為10?fmol/L的靶核酸序列。3.根據權利要求1所述的可視化核酸檢測方法,其特征在于所述的靶核酸為DNA或RNA。4.根據權利要求1所述的可視化核酸檢測方法,其特征在于所述的核酸侵入反應體系包含?MOPS、?Tween-20、Nonidet?P40、上游探針、下游探針、?發夾探針、MgCl2以及靶核酸。5.根據權利要求4所述的可視化核酸檢測方法,其特征在于所述的核酸侵入反應體系包括10?mmol/L?MOPS,pH?7.5,0.05?%?Tween-20,0.05?%?Nonidet?P40,0.1μmol/L上游探針,0.2?μmol/L下游探針,0.2?μmol/L發夾探針,7.5?mM?MgCl2和靶核酸。6.根據權利要求1所述的可視化核酸檢測方法,其特征在于所述的核酸5’外切酶或5’flap內切酶選自TaqPol、TthPol、TaqExo、AfuFEN、PfuFEN、MjaFEN或MthFEN。7.根據權利要求6所述的可視化核酸檢測方法,其特征在于所述的5’flap內切酶為AfuFEN。8.?根據權利要求1所述的可視化核酸檢測方法,其特征在于步驟(1)所述的反應溫度可以通過恒溫水浴儀實現;步驟(3)所述的納米金-寡核苷酸探針檢測結果可通過人眼直接觀察,或拍照保存結果。
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