1.一種鑒定紅鰭東方鲀親子關系的微衛星引物組,其特征在于,所述引物針
對紅鰭東方鲀基因組的不同連鎖群;所述引物選自如下引物對中的3-10對:
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2.根據權利要求1所述的微衛星引物組,其特征在于,所述引物組由如下引
物對組成:
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3.一種鑒定紅鰭東方鲀親子關系的試劑盒,其特征在于,包括權利要求1
至2中任一項所述的鑒定紅鰭東方鲀親子關系的微衛星引物組。
4.一種鑒定紅鰭東方鲀親子關系的分子標記方法其特征在于采用以下步驟:
(1)選擇下述44對特異微衛星引物進行PCR反應;
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(2)采集不同家系親本和子代個體的鰭條,提取基因組DNA;
(3)用步驟(2)的基因組DNA為模板,步驟(1)所選擇的44對微衛星
引物進行PCR擴增;
(4)對步驟(3)的PCR產物用擴增產物經8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳
檢測,硝酸銀染色、顯色后,凝膠在HPscanjetG4010掃描儀成像;
(5)將PCR的電泳檢測結果數字化處理,用遺傳分析軟件進行分析;
(6)獲得每個微衛星標記的排除率,統計3-10個標記的累積排除率;利用
排除率前5位的標記組合使用,完成家系子代與親本的親子關系鑒定;
(7)利用親本與子代的親子關系,就能將不同紅鰭東方鲀家系區分開來。
5.根據權利要求4所述的方法,其特征在于,步驟(3)中,在進行PCR擴
增時,PCR反應總體積為25μL,包括:10×Buffer2.5μL,25mmol/L的
Mg
2+1μL,各2mmol/L的dNTPs1μL,10μmol/L的正、反向引物各1
μL,50ng/μL的模版DNA1μL,TaqDNA聚合酶1U,加適量ddH
2O。
6.根據權利要求4所述的方法,其特征在于,步驟(3)中,PCR反應程序
為:94℃預變性3min,94℃變性30s,退火30s--72℃延伸30s進行30個循
環,最后72℃延伸10min。
7.根據權利要求4所述的方法,其特征在于,步驟(5)中,使用的遺傳分
析軟件為Gel-ProAnalyzer4.5凝膠分析軟件和CERVUSVersion3.0。
8.根據權利要求4所述的方法,其特征在于,步驟(6)中,用遺傳分析軟
件對電泳譜帶進行數字化處理,計算每個微衛星標記的排除率;按照排除率
高低,挑選排序前10位的微衛星標記,3-10個微衛星標記的累積排除率范
圍為95.79%-99.99%;利用5個排除率排序在前的微衛星標記完成了家系親
本與子代的親子關系鑒定。
9.根據權利要求4所述的方法,其特征在于,步驟(6)中,排除率前5位
的微衛星標記名稱和序列信息如下: