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用于檢測艾滋病治療藥物3TC和FTC耐藥突變位點的引物對和探針及其應用

  • 專利類型:發明專利
  • 有效期:不限
  • 發布日期:2021-07-27
  • 技術成熟度:正在研發
交易價格: ¥面議
  • 法律狀態核實
  • 簽署交易協議
  • 代辦官方過戶
  • 交易成功

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  • 技術(專利)類型 發明專利
  • 申請號/專利號 CN201510035285.7 
  • 技術(專利)名稱 用于檢測艾滋病治療藥物3TC和FTC耐藥突變位點的引物對和探針及其應用 
  • 項目單位 江蘇發士達生物科技有限公司
  • 發明人 龔劍,唐乃平,談小龍,李娟 
  • 行業類別 醫療器械-口腔科設備
  • 技術成熟度 正在研發
  • 交易價格 ¥面議
  • 聯系人 韓滟君
  • 發布時間 2021-07-27  
  • 01

    項目簡介

    本發明公開了一種艾滋病治療藥物3TC和FTC耐藥突變位點的引物對和探針,包括檢測HIV-1病毒RNA的pol基因的第184位、151位和65位突變位點M184V、M184I、Q151M和K65R的ARMS引物和Taqman探針。本發明還提供了上述引物對和探針在檢測3TC和FTC主要耐藥突變位點M184V,M184I、Q151M和K65R中的應用。本發明試劑盒檢測靈敏度高、特異性好、檢測成本低,為臨床艾滋病患者治療提供了用藥指導,實現了艾滋病患者個體化治療,能夠提高藥物有效果性,延長艾滋病患者生存時間,具有廣泛應用前景和社會效益。
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  • 02

    說明書

    1.用于檢測艾滋病治療藥物DDI和TDF耐藥突變位點的引物對和探針,其特征在于:包括檢測HIV-1病毒RNA的pol基因的第65位、70位和151位突變位點K65R、K70E和Q151M的ARMS引物對和Taqman探針;K65R的ARMS引物對的上游引物和下游引物分別為SEQIDNo.1和SEQIDNo.2所示的核苷酸序列,Taqman探針為SEQIDNo.3所示的核苷酸序列,分別用FAM和BHQ1標記5’端和3’端;K70E的ARMS引物對的上游引物和下游引物分別為SEQIDNo.4和SEQIDNo.2所示的核苷酸序列,Taqman探針為SEQIDNo.3所示的核苷酸序列,分別用HEX和BHQ1標記5’端和3’端;Q151M的ARMS引物對的上游引物和下游引物分別為SEQIDNo.5和SEQIDNo.6所示的核苷酸序列,Taqman探針為SEQIDNo.7所示的核苷酸序列,分別用ROX和BHQ1標記5’端和3’端。2.用于檢測艾滋病治療藥物DDI和TDF耐藥突變位點的引物對和探針,其特征在于:包括檢測HIV-1病毒RNA的pol基因的第65位突變位點K65R的ARMS引物對和Taqman探針;K65R的ARMS引物對的上游引物和下游引物分別為SEQIDNo.1和SEQIDNo.2所示的核苷酸序列;ARMS引物對的Taqman探針為SEQIDNo.3所示的核苷酸序列,分別用FAM和BHQ1標記5’端和3’端。3.用于檢測艾滋病治療藥物DDI和TDF耐藥突變位點的引物對和探針,其特征在于:包括檢測HIV-1病毒RNA的pol基因的第70位突變位點K70E的ARMS引物對和Taqman探針;K70E的ARMS引物對的上游引物和下游引物分別為SEQIDNo.4和SEQIDNo.2所示的核苷酸序列;ARMS引物對的Taqman探針為SEQIDNo.3所示的核苷酸序列,分別用HEX和BHQ1標記5’端和3’端。4.用于檢測艾滋病治療藥物DDI和TDF耐藥突變位點的引物對和探針,其特征在于:包括檢測HIV-1病毒RNA的pol基因的第151位突變位點Q151M的ARMS引物對和Taqman探針;Q151M的ARMS引物對的上游引物和下游引物分別SEQIDNo.5和SEQIDNo.6所示的核苷酸序列;ARMS引物對的Taqman探針為SEQIDNo.7所示的核苷酸序列,分別用ROX和BHQ1標記5’端和3’端。5.權利要求1至4任一項所述的引物對和探針在檢測艾滋病治療藥物DDI和TDF耐藥突變位點中的應用。6.用于檢測艾滋病治療藥物DDI和TDF耐藥突變位點的試劑盒,其特征在于:包括權利要求1至4任一項所述的ARMS引物對和探針。7.根據權利要求5所述的用于檢測艾滋病治療藥物DDI和TDF耐藥突變位點的試劑盒,其特征在于:還包括RT-PCR混合液、混合酶液、陽性對照品混合液、陰性對照品混合液;所述RT-PCR混合液包括RT-PCR緩沖液、dNTPs、MgCl2、3對上下游引物及3條探針;所述混合酶液包括M-MLV逆轉錄酶和TaqDNA聚合酶。8.根據權利要求6所述的用于檢測艾滋病治療藥物DDI和TDF耐藥突變位點的試劑盒,其特征在于,各組分含量分別為:RT-PCR混合液875uL;混合酶液125uL;陽性質控品45uL;陽性對照品混合液45uL;陰性對照品混合液45uL。9.根據權利要求7所述的用于檢測艾滋病治療藥物DDI和TDF耐藥突變位點的試劑盒,其特征在于:所述RT-PCR混合液包括:RT-PCR緩沖液(20mMTris-Hcl,100mMNaCl,pH8.3)終濃度1×;dNTPs終濃度3mM;MgCl2終濃度為1.6mM;各ARMS引物對的上、下游引物的終濃度均為200nM;各ARMS引物對的Taqman以及試劑盒質控品引物對的Taqman探針終濃度均為300nM;所述混合酶液包括:M-MLV逆轉錄酶終濃度2U/μL;TaqDNA聚合酶終濃度0.05U/μL;所述陽性對照品混合液中模板cDNA終濃度0.1~10ng/μL。10.權利要求6至9任一項所述的試劑盒在檢測艾滋病治療藥物DDI和TDF耐藥突變位點中的應用,其特征在于:包括以下步驟:(1)總RNA提取:提取待測樣本的RNA,提到模板RNA溶液;(2)反應組分配制:分別配制檢測混合物、陽性對照品混合物和陰性對照品混合物;其中,檢測混合物按PCR混合液17.5uL、混合酶液2.5uL、模板RNA溶液5uL配制一人份;陽性對照品混合物按PCR混合液17.5uL、混合酶液2.5uL、陽性對照品混合液5uL配制一人份;陰性對照品混合物按PCR混合液17.5uL、混合酶液2.5uL、陰性對照品混合液5uL配制一人份;(3)擴增:分別將檢測混合物、陽性質控品混合物、陽性對照品混合物和陰性對照品混合物放入熒光定量PCR儀擴增,按以下程度進行擴增:42℃,10min,1cycle;95℃,3min,1cycle;95℃,5S,55℃,40S,45cycles;(4)結果判定:根據熒光信號到達設定閾值所經歷的循環數Ct值判定結果:當陽性質控品和陽性對照品的Ct值小于等于35,或者檢測混合物為陽性時,試劑盒有效;當陽性質控品或陽性對照品的Ct值大于35,或者檢測混合物無Ct值時,試劑盒無效或需重復檢測。11.如權利要求10所述的應用,其特征在于:步驟(4)中,根據檢測混合物的Ct值定性判定,依據為:Ct>40時,待測樣本中無HIV治療藥物DDI和TDFF耐藥突變;35≤Ct≤40時,待測樣本可疑,需重檢一次,重檢結果如Ct>40或無擴增曲線,則為待測樣本中無HIV治療藥物DDI和TDFF耐藥突變,反之則為待測樣本中有HIV治療藥物DDI和TDFF耐藥突變;Ct﹤35時,待測樣本中有HIV治療藥物DDI和TDFF耐藥突變產生。
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專利技術附圖

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