1.一種霍亂弧菌(VC)的實時熒光核酸恒溫擴增檢測試劑盒,包含有一條序列表
中序列1所示的霍亂弧菌VC的靶標核酸即VC?RNA的捕獲探針,一對用于在M-MLV反
轉錄酶作用下產生VC靶標核酸VC?RNA的DNA拷貝的VC檢測引物T7和nT7,一條用
于與在T7RNA聚合酶作用下根據所述VC靶標核酸VC?RNA的DNA拷貝產生的RNA拷貝
特異結合的VC檢測探針,一條用于與VC核苷酸序列互為競爭、與捕獲探針特異性結
合并使用同一對引物即T7和nT7的VC內標核苷酸即VC?IC?RNA,和一條與VC內標核
苷酸的DNA拷貝產生的RNA拷貝特異性結合的VC內標檢測探針;
所述捕獲探針的核苷酸序列如序列表中序列2所示;所述VC檢測引物由T7引物
和nT7引物組成,T7引物序列如序列表中序列3所示,nT7引物序列如序列表中序列
4所示;所述VC檢測探針的核苷酸序列如序列表中序列5所示,5’端標記FAM熒光
基團,3’端標記DABCYL淬滅基團;所述VC內標檢測探針的核苷酸序列如序列表中序
列6所示,5’端標記HEX熒光基團,3’端標記DABCYL淬滅基團。
2.根據權利要求1所述的試劑盒,其特征在于:所述試劑盒還包含有M-MLV反轉
錄酶和T7RNA聚合酶,所述M-MLV反轉錄酶和T7RNA聚合酶存在于一SAT酶液中,
所述捕獲探針存在于一核酸提取液中,所述T7引物、nT7引物、VC檢測探針和VC內
標檢測探針存在于一VC檢測液中。
3.根據權利要求1至2任一所述的試劑盒,其特征在于:所述試劑盒包含裂解液、
核酸提取液、洗滌液、VC反應液、VC檢測液、SAT酶液、VC陽性對照、VC陰性對照
和VC內標,其中:
裂解液:含硫酸銨((NH
4)
2SO
4)和HEPES;
核酸提取液:含捕獲探針和磁珠;
洗滌液:含NaCl和SDS;
VC反應液:含dNTP和NTP;
VC檢測液:含T7引物、nT7引物、VC檢測探針和內標檢測探針;
SAT酶液:含M-MLV反轉錄酶、T7RNA聚合酶;
VC陽性對照;含霍亂弧菌toxR的體外轉錄RNA稀釋物;
VC陰性對照:不含有霍亂弧菌靶標核酸序列或不含有霍亂弧菌的溶液;
VC內標:VC?IC?RNA,序列如序列表中序列7所示。
4.根據權利要求3所述的試劑盒,其特征在于:所述VC陰性對照為生理鹽水。
5.根據權利要求3所述的試劑盒,其特征在于:所述試劑盒中一個反應單位中各
種試劑組成如下:
(1)裂解液:HEPES25-250mM,(NH
4)
2SO
45-50mM;
(2)核酸提取液:HEPES50-400mM,EDTA40-200mM,LiCl400-2000mM,捕獲探
針1-50μM,磁珠50-500mg/L;
(3)洗滌液:HEPES5-50mM,NaCl50-500Mm,1%SDS,EDTA1-10mM;
(4)VC反應液:Tris10-50mM,MgCl
210-40mM,dNTP0.1-10mM,NTP1-20mM,
PVP401-10%,KCl5-40mM;
(5)VC檢測液:將VC檢測引物和VC檢測探針溶解在TE溶液,10mM?Tris和1mM
EDTA的混合液中配制而成,各引物和探針濃度在5-15pmol/反應。
(6)SAT酶液:M-MLV反轉錄酶400-4000U/反應、T7RNA聚合酶200-2000U/反
應、2-10mM?HEPES?pH7.5、10-100mM?N-acetyl-L-cysteine、0.04-0.4mM?zinc?acetate、
10-100mM?trehalose、40-200mM?Tris-HCl?pH8.0、40-200mM?KCl、0.01-0.5mM?EDTA、
體積百分比0.1-1%Triton?X-100和體積百分濃度20-50%glycerol;
(7)VC陽性對照;含10
5-10
8拷貝/mL霍亂弧菌(VC)toxR的體外轉錄RNA稀釋
物;
(8)VC陰性對照:不含有霍亂弧菌靶標核酸序列或不含有霍亂弧菌的溶液;
(9)VC內標:含10
5-10
8拷貝/mL?VC?IC?RNA體外轉錄RNA稀釋物。
6.根據權利要求5所述的試劑盒,其特征在于:試劑(2)核酸提取液中,捕獲
探針5-25μM,磁珠50-250mg/L;試劑(4)VC反應液中,dNTP濃度為0.5-5mM,
NTP濃度為1-10mM;試劑(5)VC檢測液中,T7引物濃度為12.5pmol/反應,nT7引物
濃度為12.5pmol/反應,VC檢測探針濃度為5pmol/反應,內標檢測探針濃度為5pmol/
反應;試劑(6)SAT酶液中,M-MLV反轉錄酶為500-1500U/反應,T7RNA聚合酶為
500-1000U/反應。
7.根據權利要求5或6所述的試劑盒,其特征在于:由A盒即標本處理單元和B
盒即核酸擴增檢測單元組成,其中A盒包裝所述裂解液、所述核酸提取液和所述洗滌
液,B盒包裝所述VC反應液、VC檢測液、SAT酶液、VC陽性對照、VC陰性對照及VC
內標。
8.根據權利要求5至7中任一所述的試劑盒,其特征在于:所述VC陽性對照中
的體外轉錄的VC?RNA以下述方法制備:
(1)用化學合成法合成VC?toxR中無二級結構且高度保守區段作為擴增靶序列區
域的片段,其核苷酸序列如序列表中序列8所示;
(2)將片段克隆到
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載體中,構建VC陽性對照質粒;
(3)VC陽性對照質粒轉化到大腸桿菌DH5α中,命名為
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菌株,貯存于
-70℃;
(4)純化去除DNA,并定量、鑒定RNA;
存在VC內標時,體外轉錄的VC?IC?RNA以下述方法制備:
(1)用化學合成法合成一段除探針檢測區域序列不同,其他序列基本同VC靶標
序列區域的片段,其核苷酸序列如序列表中序列9所示;
(2)將片段克隆到
![]()
載體中,構建VC內標質粒;
(3)VC內標質粒轉化到大腸桿菌DH5α中,命名為
![]()
IC菌株,貯存于
-70℃;
(4)純化去除DNA,并定量、鑒定內標RNA。