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一種結核分枝桿菌乙胺丁醇耐藥突變的檢測方法及試劑盒

  • 專利類型:發明專利
  • 有效期:不限
  • 發布日期:2021-07-20
  • 技術成熟度:通過小試
交易價格: ¥面議
  • 法律狀態核實
  • 簽署交易協議
  • 代辦官方過戶
  • 交易成功

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  • 技術(專利)類型 發明專利
  • 申請號/專利號 CN201110137819.9 
  • 技術(專利)名稱 一種結核分枝桿菌乙胺丁醇耐藥突變的檢測方法及試劑盒 
  • 項目單位 廈門大學
  • 發明人 李慶閣,胡思玉,陳曉云,付軍,那巴古·耶罕姆 
  • 行業類別 藥品-包裝材料
  • 技術成熟度 通過小試
  • 交易價格 ¥面議
  • 聯系人 褚林妍
  • 發布時間 2021-07-20  
  • 01

    項目簡介

    一種結核分枝桿菌乙胺丁醇耐藥突變的檢測方法及試劑盒。涉及結核分枝桿菌耐藥突變的檢測技術,提供一種設計簡單,可簡化操作、提高分析靈敏度、成本低廉的結核分枝桿菌乙胺丁醇耐藥突變的檢測方法及試劑盒。提取結核分枝桿菌樣本的DNA;根據結核分枝桿菌embB基因序列,利用引物設計軟件PrimerPremier 5設計引物和探針;構建PCR反應體系,進行PCR檢測;進行熔解曲線分析及檢測結果判斷:通過分析熔解曲線的Tm變化確定該探針所覆蓋區域是否發生突變。采用3對引物4條探針建立雙管雙色體系體系從而實現對位于embB基因上的6個密碼子306、368、378、380、406和497的突變檢測。
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  • 02

    說明書

    1.一種結核分枝桿菌乙胺丁醇耐藥突變的檢測試劑盒,其特征在于設有盒體、擴增試劑、對照試劑和提取試劑,所述擴增試劑、對照試劑和提取試劑放置在盒體內,所述擴增試劑包括EMB?PCR?MixA、EMB?PCR?Mix?B和TB酶混合液,所述對照試劑包括EMB陽性對照和TB陰性對照,所述提取試劑為TB?DNA提取液;?所述EMB?PCR?Mix?A包括1×buffer,甘油5%,dNTP/dUTP?Mix,MgCl2溶液3mM,0.4μM306-F,2μM306-R,0.2μM306-P,0.4μM497-F,2μM497-R,0.2μM497-P;所述1×buffer為50mM?KCl,10mM?Tris-HCl,pH=8.6;所述dNTP/dUTP?Mix為dATP、dCTP、dGTP各0.2mM,dUTP0.4mM;?所述EMB?PCR?Mix?B包括1×buffer,甘油5%,MgCl2溶液3mM,dNTP/dUTP?Mix,0.4μM368-406-F,2μM368-406-R,0.2μM368-380-P,0.2μM406-P;所述1×buffer為50mM?KCl,10mM?Tris-HCl,pH=8.6;所述dNTP/dUTP?Mix為dATP、dCTP、dGTP各0.2mM,dUTP0.4mM;?所述EMB陽性對照為EMB野生型標準質粒;所述TB陰性對照為TB?DNA提取液、H2O、Tris或生理鹽水;所述TB?DNA提取液的成分為乙二胺四乙酸二鈉、Tris和TritonX-100;?306-F、306-R、368-406-F、368-406R、497-F、497-R、306-P、368-380-P、406-P、497-P的具體序列為:?306-F:5′-GCGCGAATACGTCGGACAA-3′?306-R:5′-CAGCAGCGACCAGCACACTA-3′?368-406-F:5′-AGCGACGCCAGTCTGTGGAT-3′?368-406R:5′-TGGCTGTACCGCATGGACCTT-3′?497-F:5′-TTGCCGTTGGTGTCGCCGAT-3′?497-R:5′-CGGTGGGCAGGATGAGGTAGTAGT-3′?306-P:5′-FAM-TCGGCATGGCCCGAGTCGCCG-Dabcyl-3′?368-380-P:5′-TET-TTGCCGTTTGCTGGCCTCCACACCTCACGCGGCA-BHQ1-3′?406-P:5′-FAM-TGCGGCAGAGGGCATGATGCCG-BHQ1-3′?497-P:5′-TET-TGTGGGTGTTCCGCGACCAGACCCAC-BHQ1-3′。?2.一種用于非診斷和治療目的的檢驗標本的方法,其特征在于采用如權利要求1所述的一種結核分枝桿菌乙胺丁醇耐藥突變的檢測試劑盒,所述方法包括以下步驟:?1)試劑準備——配液區?①首先將所有的試劑從冰箱中取出并平衡至室溫,PCR反應液配液標準為:取n×19.6μLEMB?PCR?Mix?A和n×0.4μLTB酶混合液加入到1.5mL離心管中,振蕩混勻數秒,3000rpm離心數秒;另取n×19.6μLEMB?PCR?Mix?B和n×0.4μLTB酶混合液加入到另一1.5mL離心?管中,振蕩混勻數秒,3000rpm離心數秒,配好的PCR反應液必需貯存在-20℃并在4h內使用;?②PCR反應液的分裝,PCR反應液A/B分別以每管20μL分裝于PCR薄壁反應管;?③將配制好的PCR反應管裝入凹凸袋轉移至提取間,貯存在-20℃直至樣品提取處理完畢;?2)樣品提取及加樣——提取區?①固體培養基上生長的結核分枝桿菌,用22SWG標準接種環收集細菌1環,并懸在250μL?TB?DNA提取液中,液體培養基中生長的結核分枝桿菌取1mL,10000rpm離心15min,丟棄上清并在250μL?TB?DNA提取液中重懸細菌;?②封口膜封口,99℃加熱20min,14000rpm離心10min,轉移上清到新1.5mL離心管,上清即為PCR擴增模板;?③用微量加液器向每支PCR薄壁反應管中加入相應的提取樣品或陰/陽性對照品5μL,立即蓋嚴管蓋;?④將已加入模板的PCR薄壁反應管轉移至PCR擴增區;?3)PCR擴增——擴增區?①儀器的程序設定如下:?第一步:50℃2min,95℃10min;?第二步:95℃15s,58℃15s,74℃20s,55個循環,58℃15s處收集熒光信號;?第三步:95℃1min,35℃5min;?第四步:40~85℃,每0.5℃收集熒光信號,熒光通道選用FAM和TET;?②程序運行完畢,將PCR薄壁反應管取出放入凹凸袋,將封口封嚴,按污染源處理;?(3)試劑盒的參考值?陽性對照,即野生型在各體系及各通道中的Tm值范圍如下:反應體系A中FAM通道野生型對照峰的Tm值為66.5℃±1℃;TET通道野生型對照峰的Tm值為61.5℃±1℃;反應體系B中FAM通道野生型對照峰的Tm值為64.5℃±1℃;TET通道野生型對照峰的Tm值為67.5℃±1℃;?其中各Tm值是在特定Bio-Rad?CFX96儀器上所得的常見值,作為參考,當使用其它儀器時,Tm值可能略有變動,以當次試驗陽性對照所得的Tm值為準;?Tm值以儀器自動判讀所得為準,當儀器給出一個以上Tm值時,請參考陽性對照和陰性對照的峰型選擇有效Tm值;當出現儀器無法自動給出Tm值的情況時,通過調整基線或直接人工判讀的方法獲得Tm值。?
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專利技術附圖

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