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環(huán)介導(dǎo)的級(jí)聯(lián)放大策略用于高靈敏檢測(cè)DNA甲基轉(zhuǎn)移酶活性

  • 專利類型:發(fā)明專利
  • 有效期:不限
  • 發(fā)布日期:2021-10-18
  • 技術(shù)成熟度:詳情咨詢
交易價(jià)格: ¥面議
  • 法律狀態(tài)核實(shí)
  • 簽署交易協(xié)議
  • 代辦官方過戶
  • 交易成功

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  • 技術(shù)(專利)類型 發(fā)明專利
  • 申請(qǐng)?zhí)?專利號(hào) CN201610873032.1 
  • 技術(shù)(專利)名稱 環(huán)介導(dǎo)的級(jí)聯(lián)放大策略用于高靈敏檢測(cè)DNA甲基轉(zhuǎn)移酶活性 
  • 項(xiàng)目單位 山東大學(xué)
  • 發(fā)明人 姜瑋,王磊,崔萬玲 
  • 行業(yè)類別 智慧健康-其他
  • 技術(shù)成熟度 詳情咨詢
  • 交易價(jià)格 ¥面議
  • 聯(lián)系人 褚慶君
  • 發(fā)布時(shí)間 2021-10-18  
  • 01

    項(xiàng)目簡(jiǎn)介

    本發(fā)明公開一種環(huán)介導(dǎo)的級(jí)聯(lián)放大策略用于高靈敏檢測(cè)DNA甲基轉(zhuǎn)移酶活性,基于鏈置換放大和指數(shù)型滾環(huán)擴(kuò)增,設(shè)計(jì)了一種長(zhǎng)莖環(huán)探針,其包括用于DNA甲基轉(zhuǎn)移酶識(shí)別的甲基化位點(diǎn)、用于確保探針穩(wěn)定的長(zhǎng)莖部和用于引發(fā)后續(xù)放大的環(huán)部。長(zhǎng)莖環(huán)探針中環(huán)部和小部分的莖部作為觸發(fā)鏈用于后續(xù)的信號(hào)輸出過程。該觸發(fā)鏈被長(zhǎng)莖部完全封閉在探針的環(huán)部,避免探針泄漏所引起的非特異性放大。長(zhǎng)莖環(huán)探針被DNA甲基轉(zhuǎn)移酶甲基化,且隨后被限制性內(nèi)切酶切割,產(chǎn)生觸發(fā)鏈。在聚合酶和切割酶的協(xié)同作用下,所產(chǎn)生的觸發(fā)鏈引發(fā)鏈置換放大,產(chǎn)生大量引物。所產(chǎn)生的引物引發(fā)指數(shù)滾環(huán)擴(kuò)增,合成大量G?四倍體序列,與染料相互作用而獲得增強(qiáng)的熒光信號(hào)。
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  • 02

    說明書

    1.一種非疾病診斷和治療目的的檢測(cè)DNA甲基轉(zhuǎn)移酶活性的方法,其特征是,具體包括以下:a、當(dāng)待測(cè)樣品中存在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶時(shí),所述DNA甲基轉(zhuǎn)移酶特異性識(shí)別和催化長(zhǎng)莖環(huán)探針發(fā)生甲基化,形成具有甲基化的長(zhǎng)莖環(huán);所述長(zhǎng)莖環(huán)探針的序列為SEQ ID NO:1、SEQID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:9所示;b、甲基化敏感型限制性內(nèi)切酶將甲基化的長(zhǎng)莖環(huán)切割成兩部分,一部分為雙鏈DNA,另一部分為新發(fā)夾探針,所述新發(fā)夾探針結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定,發(fā)生構(gòu)象轉(zhuǎn)變成單鏈DNA形成觸發(fā)鏈;c、所述觸發(fā)鏈與鏈置換模板發(fā)夾探針雜交,并在鏈置換擴(kuò)增活性的聚合酶和切割酶的作用下引發(fā)聚合和切割反應(yīng),釋放出多個(gè)引物;d、在DNA連接酶的作用下所釋放的引物與掛鎖探針雜交得到環(huán)狀探針;所述掛鎖探針序列如SEQ ID NO:13所示;e、所釋放的引物在滾環(huán)擴(kuò)增活性的聚合酶作用下觸發(fā)滾環(huán)擴(kuò)增,合成含多個(gè)串聯(lián)的富含G序列的長(zhǎng)DNA產(chǎn)物;f、切割酶切割所述長(zhǎng)DNA產(chǎn)物和掛鎖探針雜交所形成的雙鏈DNA,產(chǎn)生富含G的序列和所述引物,所述引物繼續(xù)用于引發(fā)下級(jí)滾環(huán)擴(kuò)增;g、在金屬離子的作用下,富含G的序列折疊成G-四倍體結(jié)構(gòu),其選擇性與染料作用得到增強(qiáng)的熒光信號(hào),即測(cè)得DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的活性;所述方法為非疾病診斷與治療方法。2.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征是,步驟b中,所述甲基化敏感型限制性內(nèi)切酶為各種類型DNA甲基轉(zhuǎn)移酶所對(duì)應(yīng)的限制性內(nèi)切酶;步驟c中,所述發(fā)夾探針包括莖環(huán)序列和連接在其莖部序列上的懸垂單鏈;其中,所述莖環(huán)序列中包括釋放滾環(huán)擴(kuò)增時(shí)的引物的互補(bǔ)序列和切割酶特異性識(shí)別序列,所述懸垂單鏈與觸發(fā)鏈互補(bǔ);所述鏈置換擴(kuò)增活性的聚合酶為Klenow Fragment聚合酶;所述切割酶為Nt.BbvCI酶;所釋放出的引物序列能夠特異性滾環(huán)擴(kuò)增出所述掛鎖探針互補(bǔ)序列富含G的序列;步驟d中,所述DNA連接酶為T4連接酶;所述掛鎖探針包括若干個(gè)富含C序列,相鄰的富含C序列之間為切割酶的特性識(shí)別位點(diǎn)序列,步驟e中,所述滾環(huán)擴(kuò)增活性的聚合酶為Phi29 DNA聚合酶;步驟f中,所述切割酶為Nt.BbvCI酶;步驟g中,所述金屬離子為K+,所述染料為N-甲基卟啉二丙酸IX。3.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征是,具體包括以下操作步驟:(1)向待測(cè)樣品中加入長(zhǎng)莖環(huán)探針和甲基化敏感型限制性內(nèi)切酶進(jìn)行孵育;(2)向步驟(1)反應(yīng)得到的體系中加入發(fā)夾探針、鏈置換擴(kuò)增活性的聚合酶、切割酶和擴(kuò)增原料dNTPs進(jìn)行孵育,發(fā)生鏈置換反應(yīng),釋放用于后續(xù)擴(kuò)增的引物;然后進(jìn)行酶失活;(3)向步驟(2)反應(yīng)得到的體系加入DNA連接酶和掛鎖探針進(jìn)行孵育,所釋放的引物與掛鎖探針雜交得到環(huán)狀探針;(4)向步驟(3)反應(yīng)得到的體系中加入滾環(huán)擴(kuò)增活性的聚合酶、切割酶和擴(kuò)增原料dNTPs進(jìn)行孵育,發(fā)生滾環(huán)擴(kuò)增反應(yīng);(5)向步驟(4)反應(yīng)得到的體系中加入金屬離子和染料進(jìn)行孵育,然后檢測(cè)熒光信號(hào)。4. 一種進(jìn)行DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶抑制劑/拮抗劑篩選的方法,其特征是:加入候選抑制劑/拮抗劑和所述長(zhǎng)莖環(huán)探針,進(jìn)行孵育,然后加入DNA 甲基化轉(zhuǎn)移酶;后續(xù)步驟如權(quán)利要求1的步驟b~g。
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專利技術(shù)附圖

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