1.一種提取血液中核糖體新生肽鏈復(fù)合物的RNC固定劑,其特征在于所述RNC固定劑包
含如下含量的組分:
150μg/ml 放線酮,
30mM 二硫蘇糖醇,
0.55M 氯化銨,
30mM 檸檬酸鈉,
30mM 乙二胺四乙酸,
15mM 乙二醇雙(2-氨基乙基醚)四乙酸,
20μM 1,2,3,4,6-O-五沒食子酰葡萄糖,
0.010%甘油,
余量為水。
2.權(quán)利要求l所述的RNC固定劑的制備方法,所述方法包括如下步驟:
將各組分按照含量要求用超純水配置,然后調(diào)pH至5.6,用0.22μM濾膜過(guò)濾除菌,配制
完成后置于4℃保存。
3.一種血液中RNC-RNA的提取方法,該方法包括樣品預(yù)處理、RNC捕獲和RNC-RNA抽提三
個(gè)步驟,其中樣品預(yù)處理步驟采用權(quán)利要求1所述的RNC固定劑固定和RNC捕獲步驟用權(quán)利
要求1所述的RNC固定劑重懸細(xì)胞沉淀。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的提取方法,該方法包括如下步驟:
步驟1)樣品預(yù)處理,樣品預(yù)處理包括具體步驟:
A.全血樣品準(zhǔn)備
使用含EDTA抗凝管從手臂靜脈采集新鮮全血各兩份,體積為1mL,一份用于捕獲RNC,抽
提RNC-RNA,然后分離RNC-mRNAs,另一份用于生物學(xué)重復(fù),兩份全血?jiǎng)?wù)必為同一樣品來(lái)源,
B.RNC固定及RNase抑制
采血完成后,立即對(duì)兩份新鮮全血都進(jìn)行核糖體復(fù)合物固定、裂解紅細(xì)胞、RNase抑制
以及終止所有酶活反應(yīng),保留此刻RNA-RNA的原始狀態(tài),
在采血30分鐘內(nèi),按1∶1比例加入等體積RNC固定劑到抗凝管的全血中,確保蓋子嚴(yán)密,
輕輕顛倒五次混勻,血液混合液需靜置孵育20分鐘后,4℃可保存兩天,或者-20℃以下可保
存一個(gè)星期以上,
步驟2)RNC捕獲,RNC捕獲包括如下具體步驟:
A.分離細(xì)胞
1)將血液混合液轉(zhuǎn)移到2mL離心管中,4℃低溫離心,6000g,2min,吸棄上清,
2)將細(xì)胞沉淀重懸于500μl RNC固定劑,輕柔吹打混勻后,4℃低溫離心,6000g,離心
2min,棄上清保留沉淀,
B.細(xì)胞清洗
加入預(yù)冷的0℃RNC清洗緩沖液使細(xì)胞重懸后,4℃低溫離心,2000g,5min,棄上清,清洗
兩次,保留沉淀,然后用槍頭將殘留液體吸干凈,置于冰上待用,
C.細(xì)胞冷凍保存
1)快速冷凍處理:將細(xì)胞重懸于1mL 0℃的RNC清洗緩沖液中,迅速加入液氮浸沒;
2)超低溫保存:將速凍后含細(xì)胞的離心管轉(zhuǎn)移到干冰或者低于-80℃超低溫冰箱中,進(jìn)
行儲(chǔ)存或運(yùn)輸,
3)解凍:儲(chǔ)存和運(yùn)輸后解凍,繼續(xù)進(jìn)行RNC提取,將細(xì)胞從超低溫環(huán)境迅速轉(zhuǎn)移至冰上,
直至完全解凍,在解凍過(guò)程中避免震動(dòng),
D.細(xì)胞裂解
1)加入1mL RB裂解液,輕柔顛倒混勻,保證完全覆蓋,冰上放置30min,
2)將細(xì)胞裂解液在4℃離心機(jī)下進(jìn)行離心,16000g,10min,去除細(xì)胞碎片,保留上清,
E.密度梯度離心
1)將500μl上清液分別轉(zhuǎn)移到兩份已預(yù)冷且裝有2.7mL RB 30%sucrose的超離管上
層,
2)置于超速離心機(jī)4℃,110000rpm,45min,
3)離心結(jié)束后,迅速轉(zhuǎn)移超離管到冰上,小心吸走上清,透明的沉淀輕柔溶解于200μl
RB裂解液中,得到細(xì)胞RNC,用于后續(xù)進(jìn)行RNC-RNA抽提,
步驟3)RNC-RNA抽提,RNC-RNA抽提步驟包括如下具體步驟:
A.樣品裂解
RNC-RNA的抽提起始量為200μl樣品,加入1mL
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LS Reagent到捕獲后的RNC中,
輕柔顛倒5次,冰上放置10min,
B.氯仿萃取
1)將樣品裂解液加入200μl氯仿,裂解液:氯仿體積比為5∶1,顛倒5次,冰上放置5min,
2)置4℃冷凍離心機(jī),12000g,15min,離心后轉(zhuǎn)移上清到新的1.5mL離心管中,
C.乙醇凍存及清洗
1)加入1mL 4℃預(yù)冷的無(wú)水乙醇,無(wú)水乙醇:上清體積比≥2.5∶1,充分顛倒混勻,置于-
80℃凍存1hour,
2)取出離心管,觀察無(wú)凝固后,置4℃冷凍離心機(jī),12000g,20min,棄上清,保留白色沉
淀,初步得到RNA沉淀,
3)加入1mL 4℃預(yù)冷的70%乙醇,并用槍頭輕柔將沉淀吹散,顛倒混勻,離心12000g,
5min,沖洗兩次,將殘留的乙醇吸干,晾干3min,直至白色沉淀變半透明,
D.溶解RNA
加入50μl DEPC water溶解RNA,-80℃保存,
E.質(zhì)控
1)紫外分光檢測(cè)
2)瓊脂糖檢測(cè)。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法,其中RNC清洗緩沖液包含如下組分:
0.5mM 乙二胺四乙酸,
10mM 磷酸一氫鈉,
2mM 磷酸二氫鉀,
135mM 氯化鈉,
2.5mM 氯化鉀。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的方法,其中RNC清洗緩沖液的制備方法為將各組分用超純水來(lái)
配制,調(diào)pH至7.5,121℃高壓滅菌60min,加入二硫蘇糖醇并調(diào)至終濃度為5mM DTT的體系,
配制完成后置于4℃保存。
7.根據(jù)權(quán)利4所述的方法,其中RB裂解液包含如下組分:
100μg/ml 放線酮,
30mM 蔗糖,
5mM 二硫蘇糖醇,
1%聚乙二醇辛基苯基醚,
20mM 4-羥乙基哌嗪乙磺酸,
25mM 氯化鎂,
150mM 氯化鉀。