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中華鱉四個種群種質鑒定PCR檢測法、引物組和試劑盒

  • 專利類型:發明專利
  • 有效期:不限
  • 發布日期:2021-06-25
  • 技術成熟度:通過中試
交易價格: ¥面議
  • 法律狀態核實
  • 簽署交易協議
  • 代辦官方過戶
  • 交易成功

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  • 技術(專利)類型 發明專利
  • 申請號/專利號 CN201310228445.0 
  • 技術(專利)名稱 中華鱉四個種群種質鑒定PCR檢測法、引物組和試劑盒 
  • 項目單位 浙江省水產技術推廣總站
  • 發明人 何中央,張海琪,張超,許曉軍,王春琳 
  • 行業類別 中藥材獲取-動植物采集
  • 技術成熟度 通過中試
  • 交易價格 ¥面議
  • 聯系人 錢新國
  • 發布時間 2021-06-25  
  • 01

    項目簡介

    本發明公開中華鱉四個種群種質鑒定PCR檢測法、引物組和試劑盒。該引物組為SEQ No.1 / SEQ No.4、SEQ No.2/SEQ No.5和SEQ No.3/SEQ No.6。該試劑盒包括2×Taq PCR 預混液、5U/μl酶Bgl I及10×酶切緩沖液A、5U/μl酶Hpa II及10×酶切緩沖液B、5U/μl酶Cla I及10×酶切緩沖液C、10mg/ml BSA、對照DNA模板、10pM擴增引物。該方法用引物組對提取到的DNA進行PCR擴增,然后酶切得到酶切產物,最后進行瓊脂糖凝膠電泳,將電泳結果與標準電泳圖譜比對得出結果。該檢測方法簡單、反應穩定性、重復性好,且節約成本。
    展開
  • 02

    說明書

    1.中華鱉四個種群的種質鑒定PCR檢測方法,其特性在于該方法包
    括以下步驟:
    步驟(1).總DNA的提取:
    按照常規方法提取待測樣品的DNA,然后將提取到的DNA稀釋至
    50~150ng/μl,保存于-20℃;
    步驟(2).PCR擴增:
    以步驟(1)提取到的DNA為模板,分別用3對擴增引物SEQ?ID?No.1
    /SEQ?ID?No.4、SEQ?ID?No.2/SEQ?ID?No.5和SEQ?ID?No.3/SEQ?ID?No.6
    進行PCR擴增,同時也對已知的中華鱉太湖種群、臺灣種群、黃河種群
    和中華鱉日本品系新品種對照DNA模板進行PCR擴增;
    所述的PCR擴增反應體系為50ul由25μl的2×Taq?PCR預混液、
    1μl上游引物、1μl對應的下游引物、1μl模板和余量的ddH2O組成;
    所述的2×Taq?PCR預混液為0.1U/μl?Taq酶、500uM?dNTP、2×PCR
    緩沖液的混合液;
    所述的PCR擴增反應條件為:95℃預變性3min,95℃變性30s,55~
    57℃退火30s,72℃延伸1min,反應進行35個循環,最后72℃延伸10min;
    步驟(3).酶切反應:
    對擴增引物SEQ?ID?No.1/SEQ?ID?No.4的擴增產物進行Bgl?I酶
    切,所用的酶切緩沖液為10×酶切緩沖液A;對擴增引物SEQ?ID?No.2/SEQ?
    ID?No.5的擴增產物進行Hpa?II酶切,所用的酶切緩沖液為10×酶切
    緩沖液B;對擴增引物SEQ?ID?No.3/SEQ?ID?No.6的擴增產物進行Cla?I
    酶切,所用的酶切緩沖液為10×酶切緩沖液C;
    所述的酶切反應體系為25μl由15μl步驟(2)某一擴增引物擴增待
    測DNA得到的擴增產物或對照DNA模板擴增得到的擴增產物、2.5μl?10
    ×酶切緩沖液、0.25μl?BSA、5U限制性內切酶和余量的ddH2O組成;
    所述的酶切反應條件為酶切反應體系在37℃下孵育4小時以上;
    所述10×酶切緩沖液A為1M?NaCl、500mM?Tris-HCl、100mM?MgCl2
    10mM?DTT的混合液,pH值為7.9;
    所述10×酶切緩沖液B為100mM?Bis?Tris?Propane-HCl、100mM?
    MgCl2、10mM?DTT的混合液,pH值為7.0;
    所述10×酶切緩沖液C為500mM?KAc、200mM?Tris-Ac、100mM?
    Mg(Ac)2、10mM?DTT的混合液;
    步驟(4).標準電泳圖譜的建立:
    將對照DNA模板擴增得到的擴增產物的酶切產物進行1.5﹪瓊脂糖
    凝膠電泳檢測,構建每種中華鱉的標準PCR-RFLP圖譜;
    步驟(5).待測樣品的種質來源鑒定:
    將待測樣品的三種擴增引物擴增得到的擴增產物的酶切結果進行
    瓊脂糖凝膠電泳,引物對SEQ?ID?No.1/SEQ?ID?No.4的擴增產物經Bgl?I
    酶切后,在黃河種群中出現長度為1450bp的一條帶,而其他種群中出
    現618bp和832bp的兩條帶;引物對SEQ?ID?No.2/SEQ?ID?No.5的擴增
    產物經Hpa?II酶切后,在黃河種群和臺灣種群中出現長度為715bp的
    一條帶,在日本品系新品種和太湖種群中出現330bp和385bp的兩條帶;
    SEQ?ID?No.3/SEQ?ID?No.6的擴增產物經Cla?I酶切后,在日本品系新
    品種中出現長度為980的一條帶,在其他種群中出現長度為481bp和
    499bp的兩條帶;將電泳結果與標準電泳圖譜進行比對,得出結果。
    2.如權利要求1所述的中華鱉四個種群的種質鑒定PCR檢測方法所
    用的引物組,其特征在于該引物組包括3對擴增引物SEQ?ID?No.1/SEQ?
    ID?No.4、SEQ?ID?No.2/SEQ?ID?No.5和SEQ?ID?No.3/SEQ?ID?No.6,具
    體是:
    SEQ?ID?No.1:5’-GAACCCCTATCACGAAAACG-3’,濃度為10pM;
    SEQ?ID?No.2:5’-TACAATATTACTCACAGACCGAAAC-3’,濃度為10pM;
    SEQ?ID?No.3:5’-ATAGGACAACCACGATTTCAGC-3’,濃度為10pM;
    SEQ?ID?No.4:5’-GCTATTTTTACGGCGGTTTTTG-3’,濃度為10pM;
    SEQ?ID?No.5:5’-TGGGTAGTCAGAATAGCGTCGT-3’,濃度為10pM;
    SEQ?ID?No.6:5’-TATTAGTGTAGCTTCTGGTCCCTC-3’,濃度為10pM。
    3.如權利要求1所述的中華鱉四個種群的種質鑒定PCR檢測方法所
    用的試劑盒,其特征在于該試劑盒包括pH值為8.3的2×Taq?PCR預
    混液、濃度為5U/μl的限制性內切酶Bgl?I及對應的10×酶切緩沖液A、
    濃度為5U/μl的限制性內切酶Hpa?II及對應的10×酶切緩沖液B、濃
    度為5U/μl的限制性內切酶Cla?I及對應的10×酶切緩沖液C、濃度為
    10mg/ml的牛血清白蛋白BSA、4種已知來源中華鱉的對照DNA模板和濃
    度為10pM的3對擴增引物;
    所述的2×Taq?PCR預混液為0.1U/μl?Taq酶、500uM?dNTP、2×PCR
    緩沖液的混合液;
    所述10×酶切緩沖液A為1M?NaCl、500mM?Tris-HCl、100mM?MgCl2
    10mM?DTT的混合液,pH值為7.9;
    所述10×酶切緩沖液B為100mM?Bis?Tris?Propane-HCl、100mM?
    MgCl2、10mM?DTT的混合液,pH值為7.0;
    所述10×酶切緩沖液C為500mM?KAc、200mM?Tris-Ac、100mM?
    Mg(Ac)2、10mM?DTT的混合液;
    所述的3對擴增引物分別為SEQ?ID?No.1/SEQ?ID?No.4、SEQ?ID?
    No.2/SEQ?ID?No.5和SEQ?ID?No.3/SEQ?ID?No.6所示。
    展開

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