本發明提供了一種檢測隱孢子蟲卵囊的核酸組合、試劑盒以及方法，涉及生物技術領域。該核酸組合包括：SEQ ID NO.1所示的上游引物、SEQ ID NO.2所示的下游引物、以及SEQ ID NO.3所示的熒光探針。該檢測隱孢子蟲卵囊的方法，包括：采用上述核酸組合進行RPA反應。該核酸組合通過RPA技術可快速、特異、靈敏的檢測樣品中的隱孢子蟲卵囊。該方法無需調整溫度，檢測時間短，且檢測限低、特異性強，沒有假陽性。

1.一種檢測隱孢子蟲卵囊的核酸組合，其特征在于，其包括：SEQ ID NO.1所示的上游引物、SEQ ID NO.2所示的下游引物、以及SEQ ID NO.3所示的熒光探針；所述熒光探針具有熒光發光基團和熒光淬滅基團，所述熒光發光基團和所述熒光淬滅基團配對使用并選自FAM和BHQ-1、HEX和BHQ-1、TET和BHQ-1、Cy3和BHQ-2、Cy5和BHQ-2、TAMRA和BHQ-2中的任意一組。2.一種檢測隱孢子蟲卵囊的試劑盒，其特征在于，其包括如權利要求1所述的核酸組合。3.根據權利要求2所述的檢測隱孢子蟲卵囊的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒還包括：重組酶、單鏈DNA結合蛋白、鏈置換DNA聚合酶、dNTPs、Mg²⁺和用于等溫擴增反應的緩沖液。4.根據權利要求3所述的檢測隱孢子蟲卵囊的試劑盒，其特征在于，所述重組酶為能結合單鏈核酸的重組酶。