1.一種幽門(mén)螺桿菌感染個(gè)體化治療檢測(cè)基因芯片,其特征在于芯片包括(1)幽門(mén)螺桿
菌23s基因上的克拉霉素耐藥突變位點(diǎn)A2142G和A2143G對(duì)應(yīng)的野生型和突變型SNP分型寡
核苷酸探針;(2)幽門(mén)螺桿菌gyrA基因上的喹諾酮耐藥突變位點(diǎn)N87K和D91G/Y/N對(duì)應(yīng)的野
生型和突變型SNP分型寡核苷酸探針;(3)人細(xì)胞色素酶CYP450上質(zhì)子泵抑制劑代謝相關(guān)的
2C19*2的G6981A和2C19*3的G636A對(duì)應(yīng)的野生型和突變型SNP分型寡核苷酸探針;(4)芯片
質(zhì)量控制寡核苷酸探針;(5)寡核苷酸探針固化在載體材料上形成的探針陣列;
所謂的幽門(mén)螺桿菌感染個(gè)體化治療檢測(cè)基因芯片是指同時(shí)檢測(cè)人CYP450代謝相關(guān)基
因2C19*2、2C19*3的基因類型以及幽門(mén)螺桿菌對(duì)克拉霉素和喹諾酮類藥物的耐藥基因型的
寡核苷酸陣列;
所謂的寡核苷酸探針是指能與目的基因雜交的多聚寡核苷酸,長(zhǎng)度十到五十個(gè)堿基;
所謂的質(zhì)量控制寡核苷酸探針至少包括兩種探針,即陽(yáng)性對(duì)照,陰性對(duì)照:陽(yáng)性對(duì)照用
于檢測(cè)是否正常雜交和準(zhǔn)確定位,陰性對(duì)照用于檢測(cè)雜交信號(hào)錯(cuò)誤或污染;
所謂的載體材料選自玻片、金屬片、硅片、硝酸纖維素膜;
SNP分型對(duì)應(yīng)的15條SNP分型寡核苷酸探針如下表所示:
表1.特異性探針序列
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2.如權(quán)利要求1所述的幽門(mén)螺桿菌感染個(gè)體化治療檢測(cè)基因芯片的制備方法,其特征
在于包括以下步驟:
1)設(shè)計(jì)SNP分型探針:以幽門(mén)螺桿菌23s基因和gyrA基因以及人細(xì)胞色素酶CYP450基因
為靶,從中選取權(quán)利要求1所述的探針序列;
2)合成探針:使用DNA合成儀合成;
3)探針處理:在3’或5’末端加上polyT尾巴,并進(jìn)行氨基修飾,使它能夠固化在基質(zhì)上;
4)基因芯片的制備:使用點(diǎn)樣儀在基質(zhì)上按預(yù)先設(shè)定好的順序進(jìn)行點(diǎn)樣;
5)將點(diǎn)好的芯片在室溫放置干燥18小時(shí)以上,使探針牢固固定在基質(zhì)上。