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檢測Kras基因第12、13密碼子突變位點的方法及其試劑盒

  • 專利類型:發明專利
  • 有效期:不限
  • 發布日期:2021-10-16
  • 技術成熟度:通過中試
交易價格: ¥面議
  • 法律狀態核實
  • 簽署交易協議
  • 代辦官方過戶
  • 交易成功

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  • 技術(專利)類型 發明專利
  • 申請號/專利號 CN201710769096.1 
  • 技術(專利)名稱 檢測Kras基因第12、13密碼子突變位點的方法及其試劑盒 
  • 項目單位 上海伯豪生物技術有限公司
  • 發明人 徐曉晶,趙瑩,姚琴琴,陸凌佳,賀華 
  • 行業類別 藥品-化學藥品
  • 技術成熟度 通過中試
  • 交易價格 ¥面議
  • 聯系人 褚周定
  • 發布時間 2021-10-16  
  • 01

    項目簡介

    本發明公開了一種檢測Kras基因第12、13密碼子突變位點的方法及其試劑盒,該方法包括步驟:1)提取樣本DNA,作為DNA模板;2)利用一組ARMS引物,其上游引物選自SEQ ID NO.1?8所示序列的任意一種,其下游引物為如SEQ ID NO.9所示序列;如SEQ ID NO.17所示的熒光探針和如SEQ ID NO.18所示的封閉探針,對DNA模板進行熒光PCR擴增;3)檢測熒光PCR擴增中的反應體系的熒光強度,并根據熒光強度達到設定的閾值時所需要的循環次數Ct值來判斷Kras基因第12、13密碼子突變位點的突變。該試劑盒包括:上述ARMS引物、熒光探針和封閉探針。本發明能克服現有測序技術低通量、耗時長、檢測能力有限等缺點,且具有快速、通量高、靈敏度高、特異性好等優點。
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  • 02

    說明書

    1.一種檢測Kras基因第12、13密碼子突變位點的方法,該方法不包括疾病的診斷和治療方法,其特征在于,包括以下步驟:1)提取樣本DNA,將其作為DNA模板;2)利用一組ARMS引物、一個如SEQ ID NO.17所示的熒光探針和一個如SEQ ID NO.18所示的封閉探針,對步驟1)的DNA模板進行熒光PCR擴增;所述一組ARMS引物的上游引物由SEQID NO.1-8所示序列組成,其下游引物為如SEQ ID NO.9所示序列;所述熒光探針為特異性雙環分子信標熒光探針;所述步驟2)中,熒光PCR擴增的總體積為40μl的反應體系如下:2×Premix Ex Taq (Probe qPCR) 20μlRoxⅠ(50×) 0.8μL各條引物 0.005~1.0μmol探針 0.001~1.0μmol10ng/μl DNA模板 1.0~5.0μl水補足至40μl;步驟2)中,所述熒光PCR擴增的反應條件如下:96℃預變性3分鐘,12個循環,95℃變性15秒,70℃退火延伸20秒,64℃退火延伸20秒,72℃延伸10秒;35個循環,95℃變性15秒,70℃退火延伸20秒,64℃退火延伸34秒,72℃延伸10秒;并且35個循環在退火時,檢測FAM熒光信號;3)檢測熒光PCR擴增中的反應體系的熒光強度,并根據熒光強度達到設定的閾值時所需要的循環次數Ct值來判斷Kras基因第12、13密碼子突變位點的突變;所述步驟3)中,判斷Kras基因第12、13密碼子突變位點的突變的標準為:檢測熒光PCR擴增中的反應體系的FAM熒光信號,以質控基因FAM熒光信號達到設定閾值時,表明上樣DNA量在允許范圍內,FAM信號結果可信;以FAM達到設定的閾值時所需要的循環次數Ct值作為陰陽性判斷的標準,Ct值大于等于35:陰性;Ct值小于35:陽性。2.如權利要求1所述的方法,其特征在于:所述步驟1)中,所述樣本包括:新鮮組織樣本、石蠟包埋組織切片樣本;步驟2)中,所述熒光探針的5’端和3’端分別連接有熒光基團和淬滅基團;其中,熒光基團包括:FAM、HEX、CY5和ROX;淬滅基團包括:BHQ、Eclipse 和TAMRA。3.如權利要求2所述的方法,其特征在于:所述熒光基團為FAM或ROX;所述淬滅基團為BHQ。4.如權利要求1所述的方法,其特征在于:所述步驟2)中,還包括:利用如SEQ IDNO.21-22所示的質控基因引物和SEQ ID NO.23所示的質控基因探針對步驟1)的DNA模板進行熒光PCR擴增。5.一種用于如權利要求1~4任一項所述的方法的檢測試劑盒,其特征在于,包括:一組ARMS引物,其上游引物由SEQ ID NO.1-8所示序列組成,其下游引物為如SEQ ID NO.9所示序列;一個如SEQ ID NO.17所示的熒光探針和一個如SEQ ID NO.18所示的封閉探針。6. 如權利要求5所述的試劑盒,其特征在于:所述試劑盒還包括:如SEQ ID NO.21-22所示的質控基因引物和SEQ ID NO.23所示的質控基因探針。7. 如權利要求5所述的試劑盒,其特征在于:所述試劑盒還包括:2×Premix Ex Taq(Probe qPCR)。
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