1.半巢式-RT-Realtime?PCR檢測馬鈴薯X病毒的方法,其特征在于包括以下步驟:
根據馬鈴薯X病毒全基因組中外殼蛋白基因序列保守區,設計三條引物和一條TaqMan
探針;
(1)從植物葉片中提取總RNA并測定其OD值;
(2)將提取的植物總RNA反轉錄合成cDNA;
(3)實時熒光PCR檢測,包括引物探針的特異性檢測和靈敏度檢測;
所述的三條引物和一條TaqMan探針,其中一條上游引物序列為:
5’-TGCCCAAACTGCTGCCTT-3’;另一條上游引物序列為:
5’-GGCCAGGGCACAATCCA-3’;下游引物序列為:
5’-CAGTGATACGACCTCGAGTGACA-3’;探針序列為:5’FAM-
CGACTTTGCCAGCCTAGATGCAG-3’TAMRA。
2.根據權利要求1所述的半巢式-RT-Realtime?PCR檢測馬鈴薯X病毒的方法,其特征在
于所述的特異性檢測方法為:以步驟(2)中合成的cDNA為模板進行引物探針特異性實
時熒光PCR試驗;其中,步驟(1)中所述植物葉片是感染馬鈴薯X病毒的植物葉片以及
其它相應的對照植物葉片。
3.根據權利要求1所述的半巢式-RT-Realtime?PCR檢測馬鈴薯X病毒的方法,其特征在
于所述的靈敏度檢測方法為:將上述步驟(2)中提取的感染馬鈴薯X病毒的植物葉片總
RNA進行梯度稀釋,并分別反轉錄合成cDNA,然后進行實時熒光PCR檢驗。
4.根據權利要求1所述的半巢式-RT-Realtime?PCR檢測馬鈴薯X病毒的方法,其特征在
于所述的反轉錄合成cDNA的方法為:在反應體系中加入緩沖液、反轉錄酶及其緩沖液、
隨機引物和植物總RNA,加焦碳酸二乙酯水定容,反應條件為:37℃、15分鐘,85℃、5
秒,合成cDNA;所述的緩沖液為5×PrimeScriptTM?Buffer;所述的反轉錄酶及其緩沖液
為PrimeScriptTM?RT?Enzyme?Mix?I,所述的隨機引物為Oligo?dT?Primer和Random?6?
mers。
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