1.DMD基因多重PCR捕獲引物組,所述引物組含有核苷酸序列如SEQ ID NO:1~SEQ ID
NO:290所示的引物序列。
2.根據權利要求1所述的DMD基因多重PCR捕獲引物組,其特征在于:所述引物組還含有
捕獲內參基因的引物序列。
3.根據權利要求1或2所述的DMD基因多重PCR捕獲引物組,其特征在于:所述引物序列
5’端還連接有測序平臺建庫所需的序列。
4.根據權利要求2所述的DMD基因多重PCR捕獲引物組,其特征在于:內參基因選自
GAPDH基因、β-actin基因、18s-rRNA基因。
5.DMD基因突變檢測試劑盒,包括權利要求1~4任一項所述的DMD基因多重PCR捕獲引
物組。
6.DMD基因突變檢測方法,所述方法用于非疾病診斷目的,包括:根據測序平臺建庫需
求,利用權利要求1~4任一項所述的引物組構建擴增子文庫,經文庫質控、高通量測序和生
物信息分析,獲得DMD基因的突變信息,所述突變信息包括純合性/雜合性的缺失/重復、點
突變和未知突變。
7.根據權利要求6所述的DMD基因突變檢測方法,其特征在于:所述方法進一步包括步
驟:
(1)在權利要求1或2所述的引物序列5’端連接上通用序列作為引物組,用于捕獲模板
DNA的目標區域,獲得多重PCR產物,對多重PCR產物進行純化;
(2)利用P1接頭、標簽接頭與多重PCR純化產物進行第二次PCR擴增,對不同樣品的第二
次擴增產物進行混合和純化,獲得擴增子文庫;
(3)擴增子文庫質控、proton測序,對下機數據進行生物信息學分析。
8.根據權利要求7所述的DMD基因突變檢測方法,其特征在于:引物混合比例按說明書
中表1的引物pooling系數所示。
9.根據權利要求7所述的DMD基因突變檢測方法,其特征在于:
任選地,步驟(1)中,10μL多重PCR的反應體系為:2X多重PCR緩沖液5μL、100μM primer
pool 0.5μL、gDNA 10ng、Nuclease-free Water為余量;PCR反應程序:①95℃3~5min;②12
~15個循環,每個循環:95℃30~45s、62℃1~3min、72℃30~45s;③72℃1~2min;④8~16
℃保持;
任選地,步驟(2)中,25μL的第二次PCR擴增體系:2X建庫PCR緩沖液12.5μL、標簽接頭
0.5μL、P1接頭0.5μL、多重PCR純化產物11.5μL;PCR反應程序:①98℃3~5min;②23~26個
循環,每個循環:98℃10~20s、60℃30s~2min、72℃20~40s;③72℃1~2min;④8~16℃保
持。
10.根據權利要求7所述的DMD基因突變檢測方法,其特征在于:
所述通用序列的核苷酸序列為:5’-AAATGGGCGGTAGGCTTG-3’;
所述P1接頭:5’-CCTCTCTATGGGCAGTCGGTGAT-通用序列-3';
標簽接頭:5’-CCATCTCATCCCTGCGTGTCTCCGACTCAGNNNNNNNNGAT-通用序列-3’;序列中N
表示AGCT任意堿基,NNNNNNNN用于識別不同樣品構建的文庫。
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