1.一種用于鑒定轉基因甘蔗紅糖的方法,其特征在于,包括以下步驟:
步驟1,從樣品中提取DNA,每5g紅糖按如下方式提取:
稱取紅糖5g,置于50ml的離心管中,加入20ml的CTAB裂解液,65℃溫浴溶解1小時,期間
進行兩到三次的漩渦震蕩處理;冷卻 后,加入20ml氯仿/異戊醇(24:1),搖晃震蕩均勻后,
12000rpm離心10min,用5ml的移液槍頭深入離心管底部,吸棄底層液相,再加入20ml氯仿/
異戊醇(24:1)進行抽提,如此反復2-3次;最后吸取上層水相至另一干凈的離心管內,加入
等體積預冷的異丙醇,-20℃沉淀30-60min,12000rpm離心10min,倒掉上清后,沉淀加20ml
水再次溶解,加1/10體積的NaAc,再次加入等體積預冷的異丙醇,-20℃沉淀30-60min,沉淀
再次用900ul的水進行溶解,并轉移至2ml的離心管內,加1/10體積的NaAc及等體積預冷的
異丙醇,-20℃沉淀30-60min,沉淀吹干后溶解于50-100ul的水或TE中;
步驟2,用引物組合物進行熒光定量PCR擴增,得到擴增產物;其中,所述引物組合物包
括第一引物組和第二引物組,所述第一引物組為擴增甘蔗內源基因ShSAP1的引物對,所述
第二引物組由擴增甘蔗外源基因35S的引物對、擴增甘蔗外源基因tNOS的引物對、擴增甘蔗
外源基因CP4-EPSPS的引物對、擴增甘蔗外源基因Cry1Ab的引物對、擴增甘蔗外源基因
Vip3Aa的引物對和擴增甘蔗外源基因Bar的引物對組成,其中,
擴增甘蔗內源基因ShSAP1的引物對的正向引物的序列如SEQ ID NO:1所示,反向引物
的序列如SEQ ID NO:2所示;
擴增甘蔗外源基因35S的引物對的正向引物的序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物的序
列如SEQ ID NO:4所示;
擴增甘蔗外源基因tNOS的引物對的正向引物的序列如SEQ ID NO:5所示,反向引物的
序列如SEQ ID NO:6所示;
擴增甘蔗外源基因CP4-EPSPS的引物對的正向引物的序列如SEQ ID NO:7所示,反向引
物的序列如SEQ ID NO:8所示;
擴增甘蔗外源基因Cry1Ab的引物對的正向引物的序列如SEQ ID NO:9所示,反向引物
的序列如SEQ ID NO:10所示;
擴增甘蔗外源基因Vip3Aa的引物對的正向引物的序列如SEQ ID NO:11所示,反向引物
的序列如SEQ ID NO:12所示;
擴增甘蔗外源基因Bar的引物對的正向引物的序列如SEQ ID NO:13所示,反向引物的
序列如SEQ ID NO:14所示;
步驟3,檢測擴增產物,并作出判斷。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,步驟3具體為:根據第一引物組擴增的Ct
值,擴增曲線,溶解曲線,判斷是否從紅糖中提取出了可供熒光定量PCR檢測的DNA;再根據
第二引物組的擴增曲線Ct大小,溶解曲線是否與陽性對照一致,判斷是否為轉基因甘蔗紅
糖;其中,在檢測過程中均須設置陽性對照和陰性對照。
3.根據權利要求2所述的方法,其特征在于,待檢測的紅糖樣品的Ct值在37以內,且擴
增產物的溶解曲線與正對照的溶解曲線一致時,則判斷該檢測樣品為轉基因甘蔗紅糖。
4.根據權利要求1-3中任意一項所述的方法,其特征在于,引物的退火溫度為60±2℃,
且擴增產物為短片段80-120bp。
展開