1.一種用于肺炎支原體基因分型的質譜模型的制備方法,其特
征在于,包括以下步驟:
1)分別提取肺炎支原體基因1型、2型的蛋白樣品:收集液體
培養至對數生長期的肺炎支原體基因1型、2型菌株,離心,棄上清;
將沉淀用蛋白洗滌液A洗滌,離心,棄上清;沉淀菌體用蛋白洗滌
液B和C混勻后洗滌,高速離心,棄上層蛋白洗滌液;將菌體沉淀
加入蛋白提取液A和B進行抽提,高速離心,取上層液體;
2)將基因1型和2型的肺炎支原體蛋白樣品分別上質譜儀,同
時設陰性對照,對蛋白質指紋圖譜進行標準化處理;
3)采集2000-20000Da范圍內的肽圖譜;對所得數據進行統計學
處理,肺炎支原體基因1型特征蛋白分子量分別為:2190.59,2798.57,
2970.91,3073.09,3102.52,3166.09,3245.77,3297.86,3335.11,
3384.04,4143.83,4323.90,4386.72,4715.60,4797.05,4918.58,
4952.92,5392.83,5601.63,5625.51,6149.45,6213.71,6596.82,
6773.16,6798.83,9837.83,9901.70
肺炎支原體基因2型特征蛋白分子量為:2191.52,2468.44,
2799.14,2970.91,3073.91,3102.29,3164.36,3215.28,3384.69,
3695.94,4142.42,4386.80,4439.41,4482.32,4511.86,4715.77,
4907.63,4953.18,5091.91,5390.40,5601.78,5624.20,6149.11,
6212.89,6430.88,6490.60,6773.28,6798.98,8877.41,8964.03,
9812.26,9902.45;上述分子量單位為Da;
其中,步驟1)所述蛋白洗滌液A配方為磷酸二氫鉀0.2g,磷酸氫
二鈉2.9g,氯化鈉8.0g,氯化鉀0.2g,吐溫-200.5mL,加水至1000ml,
使用鹽酸調節pH值為7.4,高壓滅菌;所述蛋白洗滌液B為18.3兆歐超
純水,所述蛋白洗滌液C為100%質譜級乙醇;所述蛋白提取液A為70%
質譜級甲酸,所述蛋白提取液B為乙腈。
2.如權利要求1所述的制備方法,其特征在于,步驟1)中所述
的離心,其參數為12000g,5min;所述的高速離心,其參數為16000g,
5min。
3.如權利要求1所述的制備方法,其特征在于,步驟2)中將肺
炎支原體蛋白樣品加入質譜樣本靶上,50-70s后,按體積比1:1在樣
品上覆蓋基質,干燥后上質譜儀進行質譜分析;所述基質為α-氰基
-4羥基肉桂酸在基質溶解液中的飽和溶液,基質溶解液:50%18.3兆
歐超純水,50%乙腈,2.5%三氟乙酸。
4.如權利要求1所述的方法,其特征在于,步驟2)所述標準化
處理是通過設定以下質譜數據庫搜索參數來實現的:譜圖校正頻率臨
界值:50;分值計算頻率臨界值:5;原始譜圖最大質量偏差:2000;校
正譜圖質量容忍度:250;單峰質量偏差限:600;強度校正參數:0.25。
5.用于肺炎支原體基因型分型的試劑盒,其特征在于,含有:
1)蛋白洗滌液A:其1L配方為磷酸二氫鉀0.2g,磷酸氫二鈉2.9g,
氯化鈉8.0g,氯化鉀0.2g,吐溫-200.5mL,加水至1000ml,使用鹽酸
調節pH值為7.4,高壓滅菌;
2)蛋白洗滌液B為18.3兆歐超純水;
3)蛋白洗滌液C為100%質譜級乙醇;
4)蛋白提取液A為70%質譜級甲酸;
5)蛋白提取液B為乙腈;
6)基質:α-氰基-4羥基肉桂酸,基質溶解液:50%18.3兆歐超
純水,50%乙腈,0.1%-3%三氟乙酸;
7)含有以下兩組肺炎支原體特征蛋白的圖譜,
1)27個特征蛋白,其分別為:分子量2190.59,2798.57,2970.91,
3073.09,3102.52,3166.09,3245.77,3297.86,3335.11,3384.04,
4143.83,4323.90,4386.72,4715.60,4797.05,4918.58,4952.92,
5392.83,5601.63,5625.51,6149.45,6213.71,6596.82,6773.16,
6798.83,9837.83,9901.70;
2)32個特征蛋白,其分別為:分子量2191.52,2468.44,2799.14,
2970.91,3073.91,3102.29,3164.36,3215.28,3384.69,3695.94,
4142.42,4386.80,4439.41,4482.32,4511.86,4715.77,4907.63,
4953.18,5091.91,5390.40,5601.78,5624.20,6149.11,6212.89,
6430.88,6490.60,6773.28,6798.98,8877.41,8964.03,9812.26,
9902.45;上述分子量單位為Da。
6.如權利要求5所述的試劑盒,其特征在于,還有肺炎支原體基
因1型、2型的蛋白樣品作為陽性對照。
7.如權利要求5所述的試劑盒,其特征在于,其工作步驟為:
1)提取待測菌體蛋白樣品:收集液體培養至對數生長期的菌株,
離心,棄上清;將沉淀用蛋白洗滌液A洗滌,離心,棄上清;沉淀
菌體用蛋白洗滌液B和C混勻后洗滌,高速離心,棄上層蛋白洗滌
液;將菌體沉淀加入蛋白提取液A和B進行抽提,高速離心,取上
層液體;
2)將待測菌體蛋白樣品分別上質譜儀,對蛋白質指紋圖譜進行
標準化處理;
3)采集數據,對所得數據進行統計學處理,若指紋圖譜峰圖中
出現下列至少70%數量的特征蛋白,則待測菌為肺炎支原體基因1
型;所述特征蛋白分子量為2190.59,2798.57,2970.91,3073.09,
3102.52,3166.09,3245.77,3297.86,3335.11,3384.04,4143.83,
4323.90,4386.72,4715.60,4797.05,4918.58,4952.92,5392.83,
5601.63,5625.51,6149.45,6213.71,6596.82,6773.16,6798.83,
9837.83和9901.70Da的多肽;
若指紋圖譜峰圖中出現下列至少70%數量的特征蛋白,則待測菌
為肺炎支原體為基因2型,所述特征蛋白分子量為2191.52,2468.44,
2799.14,2970.91,3073.91,3102.29,3164.36,3215.28,3384.69,
3695.94,4142.42,4386.80,4439.41,4482.32,4511.86,4715.77,
4907.63,4953.18,5091.91,5390.40,5601.78,5624.20,6149.11,
6212.89,6430.88,6490.60,6773.28,6798.98,8877.41,8964.03,
9812.26和9902.45Da的多肽。
8.如權利要求7所述的試劑盒,其特征在于,步驟2)所述標準
化處理是通過設定以下質譜數據庫搜索參數來實現的:譜圖校正頻率
臨界值:50;分值計算頻率臨界值:5;原始譜圖最大質量偏差:2000;
校正譜圖質量容忍度:250;單峰質量偏差限:600;強度校正參
數:0.25。
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